Tiene el cuerpo fino y muy alargado, recto, anguiliforme, con aleta caudal.
Rostro corto, tubiforme, con una cresta dorsal.
Esta especie es semejante a Syngnathus acus, aunque posee un menor tamaño.
El hocico ocupa la mitad o menos de la longitud de la cabeza.
Las aletas son pequeñas, careciendo de las pelvianas. El cuerpo es extraordinariamente fino y alargado especialmente la región del pedúnculo caudal el cual acaba en una aleta en forma de abanico.
El número de anillos corporales es de 49 a 54 siendo de 14 a19 preanales, 6 a 10 debajo de la dorsal y 16 a 22 sobre la bolsa incubadora. La aleta dorsal tiene de 28 a 32 radios, la aleta anal 3, la pectoral de 13 a 14 y la caudal de 9 a 10.
Como en todos los Syngnathiformes, existe un marcado dimorfismo sexual caracterizado por la presencia de una bolsa incubatriz (marsupium) en los machos, localizada sobre la cola y formada por dos pliegues de la piel que se ponen en contacto en medio con sus bordes libres.
Su color varía, el cuerpo es de color marrón a gris y, a veces de color verde claro. Los lados y el vientre con rayas marrones verticales en las hembras adultas.